หลังจากหยุดที่ Starbase Yorktown ซึ่งเป็นด่านหน้าห่างไกลในพื้นที่สหพันธ์ USS Enterprise ซึ่งอยู่ครึ่งทางไปสู่ภารกิจห้าปีของพวกเขาถูกทำลายโดยคลื่นมนุษย์ต่างดาวที่ไม่รู้จักหยุดนิ่ง เมื่อลูกเรือติดอยู่บนดาวเคราะห์ที่ไม่รู้จักและไม่มีหนทางช่วยเหลือชัดเจนพวกเขาพบว่าตัวเองต่อสู้กับศัตรูที่โหดเหี้ยมด้วยความเกลียดชังที่ได้รับจากสหพันธ์และทุกสิ่งที่เป็นอยู่ มีเพียงนักรบเอเลี่ยนผู้กบฏเท่านั้นที่สามารถช่วยให้พวกเขารวมตัวและออกจากโลกเพื่อหยุดยั้งภัยคุกคามร้ายแรงนี้ไม่ให้เริ่มต้นสงครามกาแล็กซี่ที่อาจเกิดขึ้นได้
